Identifikovaná osoba je povinna se registrovat na finančním úřadě jako identifikovaná osoba a přidělené DIČ používat při vystavování daňových dokladů. Identifikovaná osoba je povinna se registrovat do 15 dnů ode dne, ve kterém se stala identifikovanou osobou. Registrační formulář je stejný jako pro plátce DPH – Přihláška k registraci k dani z přidané hodnoty, ale v záhlaví se vybere možnost Typ registrace – identifikovaná osoba. Identifikovaná osoba podává přiznání k DPH pouze z důvodů výše uvedených. Pro tuzemské účely dále vystupuje jako neplátce DPH – neuplatňuje daň na výstupu a nemá nárok na odpočet na vstupu. V prvních dvou případech vzniká povinnost přiznat daň a zaplatit jí, ale identifikovaná osoba nemá (na rozdíl od plátce DPH) nárok na odpočet s přiznávaných plnění. Ve třetím případě se plnění vykáže na příslušném řádku přiznání k DPH a zároveň se uvede v souhrnném hlášení. Identifikovaná osoba na rozdíl od plátce DPH podává přiznání pouze za měsíce, ve kterých nastalo nějaké zdanitelné plnění.
Od 1. 1. 2015 přibyly tři nové důvody pro dobrovolnou registraci identifikované osoby:
- osoba povinná k dani, která bude poskytovat vybrané služby v rámci zvláštního režimu jednoho správního místa (Mini one stop shop) – viz § 6j zákona o DPH.
- osoba povinná k dani, která bude pořizovat zboží z jiného členského státu EU v hodnotě přesahující 326 000 Kč za rok – viz § 6k zákona o DPH.
- osoba povinná k dani, která bude přijímat službu, dodání zboží s instalací nebo montáží, dodání zboží soustavami nebo sítěmi (energie) od osoby z jiného členského státu EU nebo ze třetí země (mimo EU) bez ohledu na částku nebo která bude poskytovat službu s místem plnění v jiném členském státě EU – viz § 6h zákona o DPH.